Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms