Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn8Q91VA3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn8Q91VA3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms