Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc71Q8VEG0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc71Q8VEG0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc71Q8VEG0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc71Q8VEG0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc71Q8VEG0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71Q8VEG0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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