Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms