Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Fyco1Q8VDC1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms