Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd1Q8VCZ8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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