Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slf1Q8R3P9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slf1Q8R3P9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms