Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms