Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms