Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nudcd3Q8R1N4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms