Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sf3b4Q8QZY9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms