Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolbQ8K409 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms