Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrtm1Q8K377 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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