Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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