Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brd3Q8K2F0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms