Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms