Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim68Q8K243 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim68Q8K243 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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