Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek9Q8K1R7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms