Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Cldn34c1Q8K193 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Cldn34c1Q8K193 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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