Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc4a8Q8JZR6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms