Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms