Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Card11Q8CIS0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms