Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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