Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap29Q8CGF1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms