Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd1bQ8CFT2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd1bQ8CFT2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms