Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hpf1Q8CFE2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hpf1Q8CFE2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hpf1Q8CFE2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hpf1Q8CFE2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hpf1Q8CFE2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hpf1Q8CFE2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hpf1Q8CFE2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hpf1Q8CFE2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hpf1Q8CFE2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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