Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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