Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms