Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Snx30Q8CE50 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx30Q8CE50 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms