Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef8Q8CE24 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef8Q8CE24 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms