Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms