Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bcas3Q8CCN5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms