Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SynpoQ8CC35 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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