Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms