Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Dclre1bQ8C7W7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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