Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc113Q8C5T8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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