Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Usp47Q8BY87 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp47Q8BY87 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms