Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam53cQ8BXQ8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam53cQ8BXQ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam53cQ8BXQ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam53cQ8BXQ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam53cQ8BXQ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam53cQ8BXQ8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam53cQ8BXQ8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam53cQ8BXQ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam53cQ8BXQ8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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