Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms