Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7bQ8BV13 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms