Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup54Q8BTS4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms