Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

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Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms