Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl16Q8BSU2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl16Q8BSU2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl16Q8BSU2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl16Q8BSU2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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