Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcns3Q8BQZ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns3Q8BQZ8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms