Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BP99 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BP99 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BP99 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BP99 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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