Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gga3Q8BMI3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms