Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo38Q8BMI0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo38Q8BMI0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms