Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp54Q8BL06 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp54Q8BL06 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp54Q8BL06 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp54Q8BL06 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp54Q8BL06 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp54Q8BL06 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp54Q8BL06 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms