Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms