Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smarcal1Q8BJL0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms